1956年9月22日,北京大学作出关于改进学校机构的决定。决定校一级行政管理机构共设一室四处,即大学办公室、教务处、科学工作处、总务处和人事处。科学工作处下设计划组织科、研究生科和出版科。1956年10月18日,学校发布校级行政管理机构改变后各处室负责人的任命:科学工作处处长张龙翔,副处长任继愈。
1960年4月,学校决定撤销教务处和科学工作处,教学科研方面设社会科学处、自然科学处、教学行政处、生产劳动处四个处,任命王学珍为社会科学处处长(兼),夏自强、任继愈、向景洁为副处长。
1971年6月,校党委常委和校革委常委决定下设党政合一的校部办事机构一室三组一部,即办公室、政工组、教改组、后勤组、武装部。其中教改组下设教学行政组、文科组、理工科组、语言组。1972年2、3月,校部机构有所调整,教改组,下设理科组、文科组、外语组、教学行政组、资料组、校办工厂组、体育组。
1976年1月,校党委公布经市委科教组批准的校机关设置,教育革命部:下设社会科学处、自然科学处(处下设工厂组、物资组)、教学行政处(处下设行政组、教材组)。
1979年2月,校一级处以上的行政管理机构计有:校长办公室,教务部的教学行政管理处、自然科学处、社会科学处、研究生处、物资设备处,总务部的伙食管理处、房产管理处、事务处、基本建设处,人事处,外事处,人民武装部。
1999年6月,学校机构调整,原社会科学处、自然科学处、科技开发部等合并成立科学研究部,科研部下设社会科学办公室。
2000年8月,社会科学办公室从科研部独立出来,并更名为“社会科学部”。
1979年后历任处长
处长
| 夏自强
| 1979年1月—1981年夏
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处长
| 苏志中
| 1983年9月—1986年6月
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处长
| 吴同瑞
| 1986年6月—1996年6月
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处长
| 王浦劬
| 1996年6月—1998年2月
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部长
| 程郁缀
| 1998年2月—2010年9月
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部长
| 李 强
| 2010年9月—2014年4月
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部长
| 王 博
| 2014年4月—2018年1月
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部长
| 龚六堂
| 2018年1月—2021年3月
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校长助理、秘书长(代管)
| 孙庆伟
| 2021年3月—2021年5月
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部长
| 强世功
| 2021年5月—2023年11月
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部长
| 初晓波
| 2023年11月—
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